¿Qué son las Clases, Métodos y Propiedades?

Clases = ordenan el código, es una plantilla que contiene el objeto.
Publica.
Privada.

Métodos = son funciones dentro de una clase.
Propiedades = variables.

Fuente:
Cap 27/28 Máster PHP

Instancia:
Una instancia (en inglésinstance) es la particularización, realización específica u ocurrencia de una determinada claseentidad (modelo entidad-relación) o prototipo.
En general, cuando se ejecuta un programa en un computador, se dice que éste se instancia. En los lenguajes de programación orientada a objetos un objeto es una instancia de una clase. Esto es, un miembro de una clase que tiene atributos en lugar de variables. En un contexto del mundo real, podríamos pensar en "Casa" como una clase y en un chalet como una instancia de esta e incluso otro chalet u otro tipo de casa como puede ser un apartamento como otra instancia.1​ En este caso no importa el tipo de casa, si fuese de nuestro interés modelarlo y especificarlo, diferenciaríamos entre un chalet y un apartamento con dos clases, entidades o prototipos diferentes, c.f. herencia (informática) )
Fuente:
Wikipedia